L'élève est préparé à assurer le bon fonctionnement du laboratoire, à garantir la performance des installations pour les analyses et contrôles, à participer à la démarche de prévention des risques et à l'analyse des pratiques en vue d'un projet d'amélioration du fonctionnement du laboratoire.

Le BTS forme à la maîtrise : 

• des techniques d'analyses selon le plan de charge du laboratoire (de biochimie analytique, microbiologie, biologie moléculaire ou biologie cellulaire), 
• de la conformité des analyses et ainsi, à savoir rendre compte des résultats. 
• L'apprentissage des méthodes et techniques de laboratoire, lui confère une expertise comme par exemple, l'optimisation des méthodes de bio-analyse.
•  Les compétences acquises lui donnent les capacités à s'intégrer dans une équipe ou un réseau professionnel, à interagir avec des professionnels extérieurs au laboratoire. 
• Elles lui permettent aussi d'avoir une aisance pour exploiter les informations, liées aux techniques et à la qualité, ou produire une information professionnelle écrite/orale.
  Sous statut scolaire, l'élève est en stage pendant 14 semaines réparties sur les 2 années : 4 à 5 semaines en 1re année, 9 à 10 semaines en 2e année. 
• Le développement des compétences techniques de laboratoire mobilise un ensemble de savoirs scientifiques et technologiques, en particulier en biochimie, biologie cellulaire et moléculaire, microbiologie. 
• Une maîtrise de l'outil informatique est également nécessaire pour analyser, traiter les données, assurer la traçabilité des résultats et documenter les analyses. 
• Des compétences professionnelles de communication sont également développées.