Le BTS Biotechnologie permet d'acquérir les savoirs et savoir-faire spécifiques dans les technologies transversales appliquées dans divers secteurs (industries pharmaceutiques, agro-alimentaires et cosmétiques, agriculture, environnement, ...).

Les enseignements professionnels permettent à l'élève  : de maîtriser les outils numériques appliqués aux biotechnologies, de choisir un protocole opératoire adapté, de préparer les échantillons biologiques et les solutions de travail, de préparer un équipement complexe de laboratoire, de réaliser des techniques de biotechnologie moléculaire ou cellulaire en laboratoire de recherche, d'assurer la traçabilité des informations utiles aux activités de recherche et d'effectuer la fabrication d'un produit biologique à haute valeur ajoutée par procédé biotechnologique (bio-production). Ils permettent également à l'élève d'exploiter des documents techniques de fournisseurs, de participer à la démarche d'analyse et de prévention du risque, d'organiser les activités du laboratoire et d'assurer le maintien fonctionnel des équipements.

Cette formation délivre des savoirs et savoirs-faire pour la gestion opérationnelle du laboratoire, la conduite de projet de recherche en laboratoire de biotechnologies, collaborer avec les partenaires professionnels et savoir s'intégrer dans une équipe, rendre compte à l'oral ou l'écrit de son activité professionnelle, rédiger un document à visée professionnelle. L'étude de l'anglais est nécessaire pour pouvoir comprendre, exploiter les manuels et notices techniques essentiellement publiées dans cette langue. 

16 semaines de stage sont réparties en entreprise ou laboratoire : 8 semaines en 1re année, 8 en 2e..